circRNA測序

circRNAs（Circular RNAs，環狀RNA）是一類不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴、并以共價鍵形成環形結構的非編碼RNA分子。circRNAs廣泛存在于人和動植物中，是一類新的隱秘未知但卻功能異常強大的非編碼RNA。不同于線性RNA，circRNAs呈封閉環狀結構，不受RNA外切酶影響，表達更穩定，不易降解。這種特性，預示circRNAs有巨大潛力成為新的臨床診斷標志物。

最近的研究證實，circRNAs是ceRNA調控網絡中的重要成員，可以像“海綿”一樣大量吸附miRNAs，進而調控基因表達。然而，circRNAs隱秘的更強大的功能遠未被發掘和闡釋。

技術優勢

1、文庫優化：采用核糖體去除、鏈特異性文庫構建、以及RNase R消化方案，既能獲取完整的環狀RNA和線性RNA序列，也可以僅保留環狀RNA序列。

2、分析多方面：多方面分析和鑒定樣本環狀RNA和長鏈線性RNA（包括mRNA和lncRNA）。

3、 方案系統：從circRNA發掘與表達分析，環狀RNA與長鏈線性RNA互作分析，到ceRNA調控機制探析，由研究人員自由選擇研究方案。

產品優勢：

分析內容多方面：不限于對已知circRNA的研究分析，并設置嚴格的篩選條件預測新的circRNA；

數據信息量大：可一次性獲得樣本中幾乎所有的circRNA信息，有利于提高后續分析結果的準確性和多方面性；

測序物種多元：對包括人類、動植物在內的許多物種的circRNA進行鑒定和分析；

標準生信分析

1.測序數據及其質量控制：

測序堿基質量值

測序數據產出統計

2.circRNA鑒定：

CircRNA的長度分布

CircRNA 的來源統計

已知CircRNA的注釋

3.CircRNA的表達及差異表達：

CircRNA的表達水平分析

CircRNA差異表達分析結果

差異表達CircRNA篩選、

差異表達CircRNA聚類分析

4.差異CircRNA來源基因富集分析：

差異CircRNA來源基因的GO分類

差異CircRNA來源基因的GO富集層次分析

差異CircRNA來源基因的COG注釋、

差異CircRNA來源基因KEGG注釋

差異CircRNA來源基因KEGG通路富集分析

樣品要求：

1、樣品類型：總RNA；

2、樣品濃度：≥200 ng/ul；

3、樣品總量：≥10ug；

4、樣品純度：OD260/280為1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm處有正常峰值；無基因組DNA污染；

5、RNA完整性：電泳檢測28S/18S≥1.5。（據送樣日最近的電泳結果）