全基因組重測(cè)序
全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）在動(dòng)植物的研究中對(duì)于重要性狀特別是復(fù)雜形狀的定位有著快速、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn)?；诟咄繙y(cè)序?qū)δ撤N農(nóng)作物或禽畜的代表性品種、地方種或野生種進(jìn)行基因分型，結(jié)合準(zhǔn)確的表型數(shù)據(jù)可對(duì)農(nóng)作物或禽畜重要復(fù)雜性性狀進(jìn)行定位。特別是在包含了野生種、馴化種和改良種的群體中，結(jié)合群體進(jìn)化分析對(duì)收到馴化和改良的重要基因進(jìn)行定位，是研究作物或禽畜微進(jìn)化及馴化改良表型的重要思路。
應(yīng)用領(lǐng)域
全基因組范圍內(nèi)多性狀的定位；目標(biāo)性狀的生物學(xué)基礎(chǔ)研究。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1、高通量檢測(cè)全基因組SNP并進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，掃除定位盲點(diǎn)；
2、重重篩選SNP，多重檢驗(yàn)顯著性，保證結(jié)果準(zhǔn)確性；
3、同時(shí)對(duì)多種性狀進(jìn)行定位；
4、定位精度至多可達(dá)單基因水平。
標(biāo)準(zhǔn)信息分析
1、已有參考基因組序列的動(dòng)植物自然群體；
2、樣本間無(wú)明顯的亞群分化（如生殖隔離等）；
3、所研究表型性狀遺傳力較強(qiáng)。
4、≥200個(gè)樣本；
5、基于SNP：≥5 X/個(gè)體；
6、基于CNV：≥30X/個(gè)體 10~20W Tags；
7、平均8 X/Tag；
8、測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估；
9、與參考基因組比對(duì)；
10、CNV檢測(cè)及注釋 SNP檢測(cè)及注釋?zhuān)?/span>
高級(jí)信息分析
1、構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)；
2、群體主成分分析；
3、連鎖不平衡分析；
4、性狀關(guān)聯(lián)分析；
5、目標(biāo)性狀相關(guān)區(qū)域基因功能注釋?zhuān)?/span>
6、構(gòu)建單體型圖譜。
樣品要求
1、樣品類(lèi)型：基因組DNA；
2、樣品需求量：?jiǎn)未? ug；
3、樣品濃度：文庫(kù)≥30 ng/μl；
4、樣品純度：OD260/280為1.8-2.0；
5、電泳要求：主帶清晰，無(wú)降解或輕度降解。（距送樣日最近的電泳結(jié)果）
