MLST
多位點(diǎn)序列分型（multilocus sequence typing, MLST）是一種基于核酸序列測(cè)定的常規(guī)細(xì)菌分型方法。該方法由多位點(diǎn)酶電泳（multilocus enzyme electroiphoresis, MLEE）方法發(fā)展而來(lái)，通過(guò)直接測(cè)定細(xì)菌表達(dá)代謝相關(guān)酶的管家基因（House-keeping gene）的核苷酸序列，分析細(xì)菌進(jìn)化和群體生物學(xué)特征，從而進(jìn)行分型。
MLST一般測(cè)定6-10個(gè)管家基因內(nèi)部400-600bp片段的核苷酸序列，每個(gè)位點(diǎn)的序列根據(jù)其發(fā)現(xiàn)的時(shí)間順序賦予一個(gè)等位基因編號(hào)，每一株菌的等位基因編號(hào)按照指定的順序排列就是其等位基因譜，即是這株菌的ST（sequence type）。這樣得到的每一個(gè)ST均代表一組單獨(dú)的核苷酸序列信息，通過(guò)比較ST可以發(fā)現(xiàn)菌株的相關(guān)性。
MLST分析方法：針對(duì)管家基因設(shè)計(jì)引物對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序，得出每個(gè)菌株各個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)值，然后進(jìn)行等位基因圖譜（allelic profile）或序列類型（sequence types, STs）鑒定，再根據(jù)等位基因圖譜使用配對(duì)差異矩陣（matrix pair-wise differences）等方法構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)圖進(jìn)行聚類分析。實(shí)際運(yùn)用中，對(duì)于已有的成熟MLST方案的細(xì)菌，可直接從MLST數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取分型方案。
MLST可以準(zhǔn)確地記錄細(xì)菌基因水平上的變異，并且核酸序列容易獲取，所以該方法不僅被用于研究細(xì)菌的流行病學(xué)、群體生物學(xué)、致病性和進(jìn)化，而且還可以用來(lái)追溯耐藥菌株的來(lái)源和傳播。
