RNA轉(zhuǎn)錄后的加工與修飾
RNA轉(zhuǎn)錄后的加工與修飾
不論原核或真核生物的rRNAs都是以更為復(fù)雜的初級(jí)轉(zhuǎn)錄本形式被合成的,然后再加工成為成熟的RNA分子。然而絕大多數(shù)原核生物轉(zhuǎn)錄和翻譯是同時(shí)進(jìn)行的,隨著mRNA開(kāi)始的DNA上合成,核蛋白體即附著在mRNA上并以其為模板進(jìn)行蛋白質(zhì)的合成,因此原核細(xì)胞的mRNA并無(wú)特殊的轉(zhuǎn)錄后加工過(guò)程。
相反,真核生物轉(zhuǎn)錄和翻譯在時(shí)間和空間上是分天的,剛轉(zhuǎn)錄出來(lái)的mRNA是分子很大的前體,即核內(nèi)不均一RNA。hnRNA分子中大約只有10%的部分轉(zhuǎn)變成成熟的mRNA,其余部分將在轉(zhuǎn)錄后的加工過(guò)程中被降解掉。
(一)mRNA的加工修飾
原核生物中轉(zhuǎn)錄生成的mRNA為多順?lè)醋樱磶讉€(gè)結(jié)構(gòu)基因,利用共同的啟動(dòng)子和共同終止信號(hào)經(jīng)轉(zhuǎn)錄生成一條mRNA,所以此mRNA分子編碼幾種不同的蛋白質(zhì)。例如乳糖操縱子上的Z、Y及A基因,轉(zhuǎn)錄生成的mRNA可翻譯生成三種酶,即半乳糖苷酶,透過(guò)酶和乙酰基轉(zhuǎn)移酶。
原核生物中沒(méi)有核模,所以轉(zhuǎn)錄與翻譯是連續(xù)進(jìn)行的,往往轉(zhuǎn)錄還未完成,翻譯已經(jīng)開(kāi)始了,因此原核生物中轉(zhuǎn)錄生成的mRNA沒(méi)有特殊的轉(zhuǎn)錄后加工修飾過(guò)程。
真核生物轉(zhuǎn)錄生成的mRNA為單順?lè)醋樱匆粋€(gè)mRNA分子只為一種蛋白質(zhì)分子編碼。
真核生物mRNA的加工修飾,主要包括對(duì)5’端和3’端的修飾以及對(duì)中間部分進(jìn)行剪接。
1.在5’端加帽
成熟的真核生物mRNA,其結(jié)構(gòu)的5’端都有一個(gè)m7G-PPNmN結(jié)構(gòu),該結(jié)構(gòu)被稱為甲基鳥(niǎo)苷的帽子。如圖17-9所示。鳥(niǎo)苷通過(guò)5’-5’焦磷酸鍵與初級(jí)轉(zhuǎn)錄物的5’端相連。
當(dāng)鳥(niǎo)苷上第7位碳原子被甲基化形成m7G-PPNmN時(shí),此時(shí)形成的帽子被稱為“帽0”,如果附m7G-PPNmN外,這個(gè)核糖的第“2”號(hào)碳上也甲基化,形成m7G-PPNm,稱為“帽1”,如果5’末端N1和N2中的兩個(gè)核糖均甲基化,成為m7G-PPNmPNm2,稱為“帽2”。從真核生物帽子結(jié)構(gòu)形成的復(fù)雜可以看出,生物進(jìn)化程度越高,其帽子結(jié)構(gòu)越復(fù)雜。
真核生物mRNA 5’端帽子結(jié)構(gòu)的重要性在于它是mRNa 做為翻譯起始的必要的結(jié)構(gòu),對(duì)核糖體對(duì)mRNA的識(shí)別提供了信號(hào),這種帽子結(jié)構(gòu)還可能增加mRNA的穩(wěn)定性,保護(hù)mRNa 免遭5’外切核酸酶的攻擊。
2.在3’端加尾
大多數(shù)的真核mRNA 都有3’端的多聚尾巴(A),多聚(A)尾巴大約為200bp。
多聚(A)屠巴不是由DNA編碼的,而是轉(zhuǎn)錄后在核內(nèi)加上去的。受polyA聚合酶催化,該酶能識(shí)別,mRNa 的游離3’-OH端,并加上約200個(gè)A殘基。
近年來(lái)已知,在大多數(shù)真核基因的3’一端有一個(gè)AATAA序列,這個(gè)序列是mRNa 3’-端加polyA尾的信號(hào)。靠核酸酶在此信號(hào)下游10-15堿基外切斷磷酸二酯鍵,在polyA聚合酶催化下,在3’-OH上逐一引入100-200個(gè)A堿基。
關(guān)于polyA尾巴的功能問(wèn)題盡管經(jīng)過(guò)極其廣泛的探索,但還不完全清楚。有人推測(cè)polyA可能與mRNA從細(xì)胞核轉(zhuǎn)送到細(xì)胞質(zhì)有關(guān),但是相當(dāng)數(shù)量,的沒(méi)有polyA屠巴的mRNA如組蛋白mRNA,也照樣通過(guò)核膜進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。
還有人認(rèn)為這種結(jié)構(gòu)對(duì)真核mRNA的翻譯效率具有某種作用,并能穩(wěn)定mRNA結(jié)構(gòu),保持一定的生物半衰期。
3.mRNA前體(hnRNA)的拼接
原核生物的結(jié)構(gòu)基因是連續(xù)編碼序列,而真核生物基因往往是斷裂基因,即編碼一個(gè)蛋白質(zhì)分子的核苷酸序列被多個(gè)插入片斷所隔開(kāi),一個(gè)真核生物結(jié)構(gòu)基因中內(nèi)含子的數(shù)量,往往與這個(gè)基因的大小有關(guān),例如胰島素是一個(gè)很小的蛋白質(zhì),它結(jié)構(gòu)基因只有兩個(gè)內(nèi)含子,而有些很大的蛋白質(zhì),它的結(jié)構(gòu)基因中可以有幾十個(gè)內(nèi)含子。經(jīng)過(guò)復(fù)雜的過(guò)程后,切去內(nèi)元,將有編碼意義的核苷酸片段(Extron外元也叫外顯子)連接起來(lái)。
真核生物的結(jié)構(gòu)的基因中具有可表達(dá)活性的外顯子,也含有無(wú)表達(dá)活性的內(nèi)含子,但內(nèi)含子序列下是無(wú)意義的,越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)證明有許多基因中的內(nèi)含子參與基因表達(dá)調(diào)控,在轉(zhuǎn)錄時(shí),外顯子及內(nèi)含子均轉(zhuǎn)錄到hnRNA中。
在細(xì)胞核中hnRNA進(jìn)行剪接作用,首先在核酸內(nèi)切酶作用下剪切掉內(nèi)含子;然后在連接酶作用下,將外顯子各部分連接起來(lái),而變?yōu)槌墒斓膍RNA,這就是剪接作用,也有少數(shù)基因的hnRNA不需進(jìn)行剪接作用,例如α-干擾素基因,圖17-11以卵清蛋白基因?yàn)槔榻B一個(gè)典型的轉(zhuǎn)錄及加工過(guò)程。
mRNA的拼接,需要在拼接部位有供拼接識(shí)別的保守性強(qiáng)的一致順序,通過(guò)對(duì)100多種真核細(xì)胞基因的分析,發(fā)現(xiàn)外元和內(nèi)元拼接部位部分堿基順序有一定的規(guī)律。
基因區(qū)域 Exon Intron Exon 卵清蛋白內(nèi)元2 UAAG GUGA ~~~~~~~ ACAGGUUG 卵清蛋白內(nèi)元3 UCAG GUAC ~~~~~~~ UCAGUCUG β-珠蛋白內(nèi)元1 GCAG GUUG ~~~~~~~ UCAGGCUG β-珠蛋白內(nèi)元2 CAGG GUGA ~~~~~~~ ACAGUCUC Igλ內(nèi)含子1 UCAG GUCA ~~~~~~~ GCAGGGGC SV40病毒早期T抗原 UAAG GUAA ~~~~~~~ UUAGAUUC
表中劃線的堿基對(duì)拼接識(shí)別有重要作用,如將兔的β-珠蛋白的拼接部位的GT改為AT后,拼接反應(yīng)即受到影響。
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