如何提取總蛋白?
大家目前最常用的方法是利用溶液法進(jìn)行蛋白提取(如 RIPA 裂解液),但是往往會(huì)在蛋白質(zhì)提取中產(chǎn)生兩個(gè)不同的組分,即 RIPA 可溶性和 RIPA 不可溶性組分。
通常 RIPA 不可溶性組分被我們直接丟棄忽略。但是已經(jīng)有文章證實(shí)許多蛋白質(zhì)存在于被丟棄的 RIPA 不可溶性組分中。
也就是說利用溶液法提取的并非是完整的總蛋白,而僅僅是一些可溶性蛋白。
溶液法進(jìn)行提取蛋白時(shí)會(huì)人工激活 caspase-3 和 caspase-7;還會(huì)人工激活某些激酶活性;影響磷酸化研究;影響細(xì)胞外基質(zhì);影響定量,定性蛋白研究。
目前利用離心管柱式法進(jìn)行蛋白提取,即可解決以上這些問題,只需加入裂解液,過柱離心,不產(chǎn)生不可溶組份,即可提取到完整的總蛋白!
動(dòng)物組織總蛋白提取
變性總蛋白提?。⊿D-001)
以下步驟是從 15-20 mg 組織中提取,對(duì)于昆蟲組織,例如果蠅,使用 15-20 個(gè)幼蟲,蛹或成蟲樣本。如果起始量較大或者較小,需調(diào)整相應(yīng)裂解液的用量比例。
1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷
2. 將 15-20 mg 組織放置于離心管柱上,用塑料棍扭轉(zhuǎn)研磨 50-60 次,加入 200ul 細(xì)胞裂解液,繼續(xù)研磨 30-60 次。(組織用量不要過量,無需過度研磨,裂解液可分兩次加入以得到最佳效果)注意:塑料研磨棒可以重復(fù)使用,用蒸餾水徹底沖洗干凈,用紙巾擦干。
3. 蓋上蓋子室溫孵育 1-2 分鐘,14000-16000rpm 離心 1-2 分鐘取出。
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
請(qǐng)注意:部分未完全裂解的組織不會(huì)影響樣品質(zhì)量。
天然總蛋白提取(SN-002)
1. 將天然細(xì)胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷。
2. 將 15-20 mg 組織放置于離心管柱上,用塑料棍扭轉(zhuǎn)研磨 50-60 次,加入 200ul 天然細(xì)胞裂解液(SN-002),繼續(xù)研磨 30-60 次。(組織用量不要過量,無需過度研磨,裂解液可分兩次加入以得到最佳效果)。注意:塑料研磨棒可以重復(fù)使用,用蒸餾水徹底沖洗干凈,用紙巾擦干。
3. 開蓋冰上孵育 5 分鐘,蓋上蓋子,4℃,14000-16000rpm 離心 1-2 分鐘取出。
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
細(xì)胞樣品總蛋白提取
變性總蛋白提?。⊿D-001)
A.非貼壁細(xì)胞
1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷。
2. 低速離心收集細(xì)胞,在 1.5 ml 離心管中加入預(yù)冷的 PBS,旋窩震蕩,3000rpm 離心 2-3 分鐘清洗細(xì)胞。吸去上清,剩余與細(xì)胞體積相同體積的 PBS。渦旋震蕩重懸細(xì)胞。
3. 加入表格 1 中相應(yīng)體積的細(xì)胞裂解液,渦旋震蕩裂解細(xì)胞。(細(xì)胞數(shù)量和裂解液須保證對(duì)應(yīng)關(guān)系,以達(dá)到最佳提取效率)請(qǐng)注意:部分未完全裂解的細(xì)胞不會(huì)影響樣品質(zhì)量。
4. 將裂解的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出
5. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
表格 1,不同細(xì)胞體積應(yīng)加入相應(yīng)體積裂解液
細(xì)胞體積(ul) | 裂解液(ul) | 相當(dāng)細(xì)胞量# X 106 |
3 | 20 | 0.3 |
5 | 50 | 0.5 |
10 | 100 | 1 |
20 | 200 | 2 |
40 | 500 | 3 |
﹡ NIH3T3 和 293T 細(xì)胞 10ul 體積相當(dāng)于 1X106 個(gè)細(xì)胞
B. 貼壁細(xì)胞
1. 將離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷
2. 將預(yù)冷的 PBS 直接加入培養(yǎng)板,培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶中清洗貼壁細(xì)胞,吸去上清。
3. 按照表 2 中將相應(yīng)體積的細(xì)胞裂解液均勻的加入整個(gè)器皿表面,用移液器吹打幾次,將裂解的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出。(如提取濃度不佳,可減少裂解液使用量)
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
表格 2,不同貼壁細(xì)胞量應(yīng)加入相應(yīng)體積裂解液
器皿 | 細(xì)胞數(shù)量 | 裂解液(ul) |
24孔板 | 0.1-0.2 Million | 50 |
6孔板 | 0.6-0.8 Million | 200 |
25 cm2培養(yǎng)瓶 | 1.5-2 Million | 500 |
天然總蛋白提?。⊿N-002)
A.非貼壁細(xì)胞
1. 將天然細(xì)胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷。
2. 低速離心收集細(xì)胞,在 1.5 ml 離心管中加入預(yù)冷的 PBS, 旋窩震蕩,3000rpm 離心 2-3 分鐘清洗細(xì)胞。吸去上清,剩余與細(xì)胞體積相同體積的 PBS。旋窩震蕩重懸細(xì)胞。
3. 加入表格 3 中相應(yīng)體積的細(xì)胞裂解液,渦旋震蕩裂解細(xì)胞 15 秒。將離心管放置于冰上 3-5 分鐘然后渦旋震蕩 10 秒。(細(xì)胞數(shù)量和裂解液須保證對(duì)應(yīng)關(guān)系,以達(dá)到最佳提取效率)
4. 將裂解的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出
5. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
表格 3,不同細(xì)胞體積應(yīng)加入相應(yīng)體積裂解液
細(xì)胞體積(ul) | 裂解液(ul) | 相當(dāng)細(xì)胞量# X 106 |
3 | 20 | 0.3 |
5 | 50 | 0.5 |
10 | 100 | 1 |
20 | 200 | 2 |
40 | 500 | 3 |
﹡ NIH3T3 和 293T 細(xì)胞 10ul 體積相當(dāng)于 1X106 個(gè)細(xì)胞
B 貼壁細(xì)胞
1. 將天然細(xì)胞裂解液(SN-002),離心管柱及接收管套管放在冰上預(yù)冷。
2. 將預(yù)冷的 PBS 直接加入培養(yǎng)板,培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶中清洗貼壁細(xì)胞兩次,吸去上清。
3. 按照表 4 中將相應(yīng)體積的細(xì)胞裂解液均勻的加入整個(gè)器皿表面,放置于冰上孵育 5 分鐘,用移液器吹打幾次,將裂解的細(xì)胞轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的離心管柱套管中,14000-16000rpm 離心 30 秒取出。(如提取濃度不佳,可減少裂解液使用量)
4. 立刻將收集管放置于冰上,棄去離心管柱,蛋白提取完成可應(yīng)用于下游實(shí)驗(yàn)。
表格 4,不同貼壁細(xì)胞量應(yīng)加入相應(yīng)體積裂解液
器皿 | 細(xì)胞數(shù)量 | 裂解液(ul) |
24孔板 | 0.1-0.2 Million | 50 |
6孔板 | 0.6-0.8 Million | 250 |
25 cm2培養(yǎng)瓶 | 1.5-2 Million | 500 |
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